Широко известно, что когнитивно-поведенческая терапия очень эффективна для терапии расстройств первой оси (в частности, тревожных и аффективных), а схема-терапия - для терапии расстройств личности. Многие терапевты владеют обоими методами и имеют возможность выбора между ними. На практике мы чаще всего сталкиваемся с клиентами с коморбидными расстройствами, когда расстройство личности сочетается с тревожными и аффективными расстройствами. В таких случаях правильный выбор модальности далеко не всегда бинарен. Часто необходимо сочетание методов, что может приводить к затруднениям, поскольку оба метода основываются на собственной концептуализации, и переход между ними ставит перед терапевтом много практических и теоретических задач.